sexta-feira, 9 de novembro de 2012

RNA




Ficha de exercicos II : Metabolismo de RNA

1.

Replição
Transcrição
Uma região especifica de DNA e reconhecida e atacada pela polimerase
Presente
Presente
A direção da polimerização e 5ˊ, 3ˊ

Presente
Presente
A direccao do movimento da enzima no molde e 3ˊ,5ˊ exonuclease
Presente
Presente
O mecanismo da reaccao e ataque ao grupo 3ˊ OH da pentose
Presente
ausente
O processo inclui actividade 3ˊ5ˊ
Presente
ausente
O processo requer primer
Presente
ausente
Ocorre processamento pos sintese (hidrolise, adicao e modificacoes)
ausente
Presente
Ocorre ao longo de todo o DNA
Presente
ausente

2. n1 ATP

3. E xistem tres tipos de RNA que são:
RNA mensageiro: Codifica a sequencia de aminoacidos de um ou mais polipeptidios especificados por um conjunto de genes
RNA de transferencia: Transporta aminoacidos activos para os ribossomas
RNA ribossomal: Em accao com as proteinaas, compoe os ribossomas, locaol onde se processa a sintese proteica

4. Promotores sao sequencias de nucleotideos do DNA onde a enzima responsavel pela transcricao se liga e determina o local onde a trancricao vai iniciar.

5. Sequencia de consenso sao sitios de interacoes importantes para a subunidade 70S do ribossoma.

6.O gradiente de cancentracao de 5-20% permite separar por ultracentrifugacao o RNAr mais pesado e encontrado em maior quantidade no citosol, tem coeficiente 16S e 23S nas bacterias e 18S e 28S nos eucariotas. O RNA soluvel 4S que corresponde a tRNA e mRNA.

7.A Rifampicina: age inibindo a sintese do RNA bacteriano ao ligar-se a subunidade B da RNA polimerase com isso impede o inicio da transcricao.
A Actinomicina D: inibe a alongacao do DNA atacando residuos de dexoxiguaninano DNA molde dificultando o movimento RNA polimerase ao ,Longo do DNA (leitura). Inibe a transcricao.
Amantina: inibe a RNA polimerase II consequentemente interropendo a formacao do RNAm. E em concentracoes altas inibe tambem a polimerase III




8. Introns: sao sequencias de nucleotideos no RNA que nao codificam nenhum aminoacido. Eles tem como funcao separar a informacao de varios genes responsaveis pela sintese de proteinas de uma dada funcao contida no mesmo RNA.
Sequencia de Shine Delgamo:sao sequencias que ocorrem nos eucariotas o codao de iniciacao (AUG) para a posicao correcta do ribossoma 30S.
Transposons: sequencia de nucleotideos capazes de se movimentar dentro do DNA.

9. ribozima e um RNA com actividade enzimatica. Ex: introns do grupo I .

10
RNA polimerase I: sintetisa um tipo de RNA pre-ribossomal
RNA polimerase II : responsavel pela formacao de RNA
RNA polimerase III:E responsavel pela sintetise RNAt,e outros tipos de RNAS especializados.

11.
a) Os principais eventos que constitue o processamento pos-trancripcional sao: clivagem, Poliadenilacao e Capeamento .
b)
clivagem– que e a remocao de sequencias de cada extremidade, em alguns casos para a remocao de introns.
Capeamentoadicao de um residuo 7-metilguanosina na extremidade 5ˊ do grupo fosfato.
Poliadenilacaoadicao de varios residuos de adenilato.

12.A cadeia molde de DNA e tambem chamada cadeia codificante e e identica ao RNA transcrito excepto que ha U no RNA para cada T no DNA porque na molecula de RNA nao existe a base azotada timina.

13.Os erros na molecula de RNA sao menos catastroficos que erros na molecula de DNA porque o RNA codifica para a producao de uma ou um grupo de proteinas que podem ser destruidas facilmente enquanto que erro no DNA codenam a celula a destruicao.

14. Em termos energeticos faz sentido que a celula regule a transcricao nos seus estagios iniciais, porque e onde se gasta mais energia e é o ponto fraco, o que significa que se ocorre um erro todo o processo pára.

15.O factor de transcricao que actua no desenrolamento de DNA e o TFIIH .

16.O factor de transcricao que usa ATP e rho com o proposito de retirar o RNA m do molde do DNA.

17.Os papeis de TFIIH sao:
  • Desenrola o promotor de DNA.
  • Fosforila RNA polimerase.
  • Recruta o complexo de excisao de nucleotideos.

18.As reacoes de processamento de RNA nas celulas eucarioticas ocorrem no nucleo.
19.
a)Transcricao processo atraves do qual se sintetiza RNA apartir da informacao contida nos genes da molecula de DNA.
b) Unidade de transcricao e sequencia de DNA que e transcrita.
c)Transcrito primario e a molecula de RNA sintetizada, antes do seu processamento, contem exoens e introns.


20. a) A RNA polimerase possui 6 subunidades:
2faz a montagem estrutural da enzima;
faz ligação aos nucleotídeos;
’ faz ligação ao molde de DNA;
faz o reconhecimento e selectividade do Promotor. Essas 6 subunidades constituem a RNA polimerase Holoenzima.
b) Síntese assimétrica de RNA– é quando uma sequência de complementar de RNA para a síntese de RNA é feita a partir de uma fita de molde de DNA. A sequência de DNA difere da sequência de RNA em um aspecto: base T no DNA que é substituída por U no RNA

21.O RNA policistronico pode albelgar informacoa para sintese de varias proteinas enquanto que RNA monocistronico contem informacao para a sintese de uma proteina

22.
a) Clivagem (Splicing) e a remoção de sequencias de cada extremidade, em alguns casos para a remoção de introns.
b)O mecanismo que garante fidelidade deste processo e Splicing alternativo.

23.Quebrassoma ou Spliceossomo é uma estrutura com actividade catalitica, responsavel pela execusão do splicing.
a) E contituida por ribonucleoproteinas do tipo snRNA.
b) U2 Uracilo

24,
a) O RNA actua como ribossima, actua sobre si mesma
b)Os tipos de RNA cataliticos sao 6 : U1,U2, U3, U4, U5, U6, U7, U8, U9, U10.
25. O unico RNAm eucariotico que nao contem introns e o mRNA da levedura do pao(Saccharomyces cerevisiae
26. Acentuadores são genes que aumentam a expressão genica ou taxa de transcrição.

27.
Subunidade
Propriedade
α
Catalitica
Β
Catalitica
Β
Catalitica
C
Promotor


28. . Considerando que os procariotas não apresentam membrana nuclear o processo de transcrição ocorre no citoplasma, onde também ocorre a tradução, podendo no entanto ocorrer como o supra citado.
29.Nos eucariotas o papel da subunidade 45s pré-ribossomal é de produzir as subunidades 28s, 18s e 5.8s.

30.O factor sigma na transcricao reconhece o promotor pela RNA polimerase.

31.A caixa de Pribnow e a sequencia de consenso para a regiao -10 e tem com estrutura 5ˊ TATAAT 3ˊ.

32.O transcrito primaro em mamiferos e pré-RNA

33. No DNA o numero de adenosina e igual ao numero de residuos de timidina e o numero de residuos de guanosina e igual ao numero de citidina, enquanto que no RNA o numero de residuos de guanosina e igual ao numero de residuos de uridina,isso e que dita a nao aplicabilidade de algumas regras de CHARGAFF.
34. As possiveis disposicoes espaciais que as moleculaas de RNA podem adoptar sao: Planar, Globular, Folha de trevo.
35.

36.a) Defeitos em MLH1,MSH2 ou PMS2
b) Deficiencia do BRCA1 e 2



37.
e)Caixa TATA ou ATA possui sequencia de consenso que promovem transcricao de RNA
f) CAAT e a sequencia de consenso do trecho e GC e a sequencia de promotores eucarioticos por precursor de RNAm
g) Factores de transcricao-ligam se com elementos cis pra remover a expressao genica


Caso clinico 1

  1. Talassemia e quasquer alteracao que reduza a taxa de sintese de cadeias globinicas que constituem a hemoglobina. As celulas principalmente afectadas sao eritrocitos.
  2. A palvra talassemia tem uma origem Grega onde:
Thalassa= mar e Haema= sangue.
  1. Difere no padrao de hereditariedade onde: β -talassemia major e homozigotico
α Talassemia minor e heterozigptico
  1. A talassemia e uma doenca autossomica recessiva.
  2. A talassemia β afecta homozigotico e a talassemia α afecta heterrozigoticos. Quanto a esta crianca tem uma talassemia β major.


Caso clinico 2

  1. O doente apresenta uma anemia megaloblastica
  2. Esta anemia e causada pela deficiencia de vitamina B12, Acido folico
  3. A enzima que requer a cobalamina como co-factor e a metilmalonil co-A mutase
  4. Os sintomas neurologicos surgem devido a hipoxia do tecido nervoso
  5. Os sintomas neurologicos nao desapareceram devido a deficiencia de tetrahidrofolatoque transfere metilas no sistema nervoso.
  6. Os niveis sericos de acido metilmalonilmalonico e de homocisteina apresentavem se elevados neste paciente devido a
    1. a deficiencia da enzima metilmalonil co-a mutase.

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